בית כנסת אהל שמואל נמצא ברחוב אבולעפיה 38 בשכונת משכנות ישראל.
בית כנסת אהל שמואל נבנה, כמו גם בתי כנסת אחרים באזור, בדירת מגורים שנתרמה והוסבה לבית כנסת.  היזם היה הרב שמואל פדרו שבית הכנסת נקרא על שמו.  לאחר שנפטר החזיקו את בית הכנסת משפחת אלאלוף.  כיום כמעט שאין תפילות במקום ורק מידי פעם מתקיים בבית הכנסת שעור.  כן הוא משמש כמקום לימוד בבקרים.